گمرک به عنوان مرزبان اقتصادی و مجری سیاست های اقتصادی دولت مسئولیت نظارت بر مجوزهای صادره توسط سازمانهای همجوار گمرک را دارد. لذا اخذ مجوزهای لازم قبل و در حین انجام عملیات گمرکی از اهمیت ویژه ای برخوردار میباشد لازم به توضیح است این مجوزها جنبه کنترلی جهت ممانعت از ورود و یا صدور کالاهای غیر استاندارد از حیث ایمنی،سلامتی ،بهداشتی ،فرهنگی ،زیست محیطی ،امنیتی و غیره را دارد . این مجوزها به تشخیص گمرک براساس ردیف تعرفه کالا توسط صاحب کالا یا نماینده قانونی او از سازمانهای مجوز دهنده (سازمانهای همجوار ) اخذ و به گمرک ارائه میگردد واتمام عملیات گمرکی و خروج کالا از گمرک منوط به ارائه این مجوزها میباشد لازم به ذکر است با راه اندازی سامانه الکترونیکی پنجره واحد تجارت فرامرزی و ارتباط این سامانه با سیستم های الکترونیکی سازمانهای مجوز دهنده ( 22سازمان همجوار) گام بلندی در تسریع صدور مجوزها برداشته شده است .
لیست سازمانهای همجوار گمرک و مجوزدهنده
وزارت صنعت معدن تجارت
ثبت سفارش بازرگانی
سازمان غذا و دارو
سازمان ملی استاندارد ایران
انرژی اتمی
جهاد کشاورزی
اداره کل فرهنگ وارشاد اسلامی
سازمان تنظیم مقررات و ارتباطات رادیویی
وزارت دفاع
بانک مرکزی جمهوری اسلامی ایران
سازمان میراث فرهنگی
سازمان حفظ نباتات
کانون پرورش فکری کودکان و نوجوانان
سازمان حمایت از مصرف کنندگان
سازمان راهداری و حمل و نقل جادهایی( وزارت راه)
سازمان دامپزشکی
وزارت امور خارجه
معاونت علمی و فناوری ریاست جمهوری
دخانیات
وزارت امور خارجه
سازمان محیط زیست
سازمان هواپیمایی کشور